Přehrajte si své geny třeba na piáno  
Přáli byste si mít na svém MP3 přehrávači skladbu „lidský transkripční faktor Foxp2“ nebo „aktin kora štětinatého“? Není nic jednoduššího. Zadáte si příslušné sekvence na webu do Gene2Music a „skladba“ – tj. sekvence DNA převedená do tónů je vaše.

 

 

Zvětšit obrázek
Rie Takahashiová před posterem s celkem seriozní tématikou: Stresové hormony ovlivňují expresi IL-6 a VEGF v ovariálních nádorových buňkách. Jak by se to asi hrálo na klavír?

Rie Takahashiová studuje genetiku na  University of California v Los Angeles a kromě toho hraje od útlého dětství na piano. Měla tedy ideální kvalifikaci pro vytvoření programu, který je označován jako Gene2Music. To si můžeme volně přeložit jako „geny do hudby“. Své nadání rozhodně nepromrhala. Můžete se přesvědčit sami. 

 

Zvětšit obrázek
Co z ní bude? Jestli si začne hrát s Gene2Music, tak zřejmě molekulární genetička.

 


Každé z dvacítky základních aminokyselin kódovaných genetickým kódem přisoudila jiný akord klavíru. Rozsah všech akordů je asi jeden a půl oktávy, což je rozmezí lidskému uchu celkem příjemné. Akordy nebyly voleny náhodně. Bylo důležité, aby aminokyseliny, které se  podobají z biochemického hlediska, také podobně zněly. Například hydrofilní aminokyseliny znějí vyššími tóny a hydrofobní naopak zní hlouběji.

 

 

Délka tónu je dána typem kodonu. Čím vzácnější je kodon, tím kratší tón je mu programem přiřazen. Hudba proteinového řetezce tak získává určitý rytmus, který je tím výraznější, čím častěji se v něm některé aminokyselinové motivy opakují.

 

 

Program Gene2Music má přiblížit molekulární genetiku veřejnosti.
„Hudba je prostředí důvěrně známé většině lidí,“ říká Takahashiová. Sama využila program k tomu, aby vysvětlila věci z molekulární genetiky svému učiteli hry na piano.

Zvětšit obrázek
"Redakce již převedla do hudební formy kompletní oslí genom. O vydání tohoto hudebního skvostu, který by byl expedován pravidleným čtenářům Osla jako bonus, se velmi čile jedná."

„Byl překvapený a potěšený,“ komentuje Takahashiová reakci učitele v rozhovoru pro Nature. „Říkal, že to zní mnohem líp, než by čekal.“

 

 


Hudebně založenější molekulární genetici mohou pomocí Gene2Music dokonce zkoumat bílkoviny, protože opakovaným poslechem pochytí motivy a témata, kterých by si jinak jen těžko povšimli. Program by mohl pomoci i nevidomým.
Mladá genetička ale přiznává, že hlavní důvod práce na programu bylo to, že ji to bavilo. A hodlá si zábavu s geny a pianem užívat i nadále. Momentálně  komponuje skladbu, jež je variací na protein LacY permeázu.

 

Pramen: Nature, Gene2Music
 



Komentář osla:
Zkusili jsme to a opravdu to funguje. Pokud na této adrese
http://www.doe-mbi.ucla.edu/cgi/pettit/gene2musicweb
zadáte nějakou sekvenci nukleotidů, během několika vteřin program vytvoří melodii a zašle ji na vaší e-mailovou adresu ve formátu mid.

Pokud neznáte svůj genetický kód, ani žádný jiný, nevadí. Můžete si přehrát tři ukázky, které jsme si nechali poslat na naší redakční adresu:
1.) Úryvek genomu pivní kvasinky
2.) Předehra genu testosteronu (regulační spouštěcí část - promotor)
3.) Intermezo původce průjmového onemocnění (Escherichia coli O157)

Datum: 03.05.2007 22:15
Tisk článku

Vtip za stovku - neuveden
Knihy.ABZ.cz
 
 
cena původní: 49 Kč
cena: 43 Kč
Vtip za stovku
neuveden
Související články:

New Horizons míjí Triton     Autor: Tomáš Petrásek (01.04.2011)
Smí Rakušané topit uhlím?     Autor: Igor Tureček (17.04.2008)
Ig Nobel ceny 2007     Autor: Josef Pazdera (06.10.2007)
Budou se děti jmenovat „@“,...?     Autor: Josef Pazdera (19.08.2007)
Lirpain – elixír mládí     Autor: Marta Vlasáková (01.04.2007)



Diskuze:

Jak dlouho by trvalo...

Špajda,2007-05-05 11:56:38

Jak dlouho by trvalo přehrát celý lidský genom?
Můj odhad je 8 let (3 miliardy bází=1 mild. kodonů, při 4 kodonech na sekundu=250 mil. sekund=7,9 roku)
Byla by to dlouhá skladba... ale v podobě drum'n'bass,by to mohlo být na etapy na koncertech-líbili by se hlavně několika denní repetetivní úseky :-D

Odpovědět


Gratuluji

Colombo,2007-05-05 20:14:36

oběvil ste skladbu, která by mohla být úvodní skladbou pro seriál Tak jde čas. Co díl, to kousek skladby. S trochou štěstí by to pro onen seriál mohlo vystačit.

Odpovědět

opacne

hvh,2007-05-04 17:55:29

da sa z existujucej skladby poskladat proteinovy retazec? bol by zivotaschopny?

hvh

Odpovědět

vida

CC,2007-05-03 22:58:45

moderní badatel v mezidobích čekání na další grant může úspěšně dobývat šoubyznis s kmenem muzikálních patogenů

Odpovědět




Pro přispívání do diskuze musíte být přihlášeni




















Tento web používá k poskytování služeb, personalizaci reklam a analýze návštěvnosti soubory cookie. Používáním tohoto webu s tím souhlasíte. Další informace