Mitochondrie nalézáme u většiny buněk eukaryontů. Jsou jakýmisi „závody“ se špinavým provozem, které v buňce vyrábí energii. Mitochondrie ale mají i další funkce, podílejí se na syntéze hemu, lipidů, účastní se předávání a zesilování buněčných signálů a programují buněčnou smrt. Jsou také jakýmsi pozůstatkem na dobu, kdy se vyskytovaly jako volně žijící proteobakterie. Tomu nasvědčuje fakt, že si mitochondrie stále ponechávají některé z charakteristik bakterií – obklopují se dvojitou membránou, množí se stejně jako to dělají bakterie, energii získávají pomocí kaskády stejných elektron přenášejících reakcí, a stejně jako jejich společný předek mají i ony svůj vlastní genom.