Na počátku tohoto fascinujícího příběhu lovce a kořisti v říši mikrobů je vůně pomerančů. Jens Harder z německého Max Planck Insitute for Marine Microbiology v Brémách a jeho kolegové studovali společenstvo mikroorganismů, v němž žijí metanogenní archea druhu Methanothrix soehngenii, která rozkládají limonen, látku vytvářející vůni pomerančů, na metan a oxid uhličitý.
Na první pohled na to moc nevypadá, ale nenápadná methanothrix je jedním z nejvýznamnějších producentů metanu na Zemi. Vědci si všimli že některé z jejích buněk byly mrtvé. V podezření se ocitl Candidatus Velamenicoccus archaeovorus, doposud nekultivovaný ultramikrobakteriální anaerobní predátor z linie Omnitrophica (dříve známé jako OP3). Aby potvrdili, že methanothrix zabíjí velamenicoccus, jehož buňky mají průměr pouhých 200 nanometrů, prohledali genom podezřelé bakterie.
Našli tam intron čili vmezeřenou sekvenci, která se obvykle vystřihuje při zpracování genetické informaci. Introny jsou úplně běžné u eukaryot, u bakterií jsou méně obvyklé. Když už v bakteriální genomu, jsou nějaké introny, chovají se jako mobilní genetické elementy. Po přeložení transkripcí do RNA jsou funkční jen tehdy, když jsou správně vystřižené díky ribozymové aktivitě samotného intronu.
Pozoruhodný zvrat nastal ve chvíli, kdy vědci použili vlastnoručně vyvinuté metody pro odhalení i velmi malého množství RNA v bakteriálních buňkách. Vystopovali intronovou RNA jak v živých buňkách velamenicoccuse, tak i v mrtvých buňkách methanothrix. Harder s kolegy dokonce zastihli tento mobilní genetický element, když se pokoušel proniknout do buňky „kořisti.“ Jenže velamenicoccus, mezitím dotyčnou buňku nového hostitele methanothrix zlikvidoval.
##seznam_reklama##
Pro intronovou RNA to tedy dopadlo neslavně. Pokus o přesun do jiného genomu skončil v biologicky mrtvé schránce. Zato Harder a spol. jásají, protož se jim jako prvním povedlo pozorovat intronovou RNA v akci. Podle nich jde o první přímý důkaz, že se tyto mobilní genetické elementy mohou přenášet z jednoho druhu na druhý, a to dokonce z predátora na jeho kořist. Teď bude velice zajímavé zjistit, co tam intronová RNA vlastně měla v úmyslu dělat.
Video: Extraction of Limonene from Mandarin Peel | Essential Oil Extraction | Organic Chemistry Experiment
Literatura